学校前身为1973年创办的钦州地区师范学校;1985年6月,广西区政府同意增设广西师范学院钦州分院;;1991年5月,国家教委批准设立钦州师范高等专科学校(保留钦州地区教育学院);2004年6月,始建于1906年的钦州民族师范学校并入钦州师范高等专科学校;2006年2月,教育部批准学校升格为钦州学院;2018年3月,国务院学位委员会批准学校成为硕士学位授权单位;2018年11月,教育部批准在钦州学院基础上设立北部湾大学。2021年9月,学校成为广西2021-2025年立项建设新增博士学位授予单位(博士B类)。
罗勇歧:2000.10-2005.7月任钦州师范高等专科学校校长;徐书业:2005.7-2006.9月任钦州师范高等专科学校校长;李尚平:2006.9-2012.6月任钦州学院院长;徐书业:2012.6-2016.2.19任钦州学院院长;韩峻峰:2016.02.19-2019.2.1任钦州学院院长;韩峻峰:2019.2.1--2020.2.12任北部湾大学校长;林基明:2020年12月-2022.04.08任北部湾大学校长。
截至2022年04月学校官网显示,学校设有海洋学院、海运学院(船员培训中心)、机械与船舶海洋工程学院(工程训练中心)、石油与化工学院、食品工程学院、电子与信息工程学院、建筑工程学院、资源与环境学院、理学院、经济管理学院、人文学院、国际教育与外国语学院、陶瓷与设计学院、教育学院、东密歇根联合工程学院、马克思主义学院、体育学院、继续教育学院、创新创业学院等19个教学单位。共设小学教育、化学工程与工艺、航海技术、船舶与海洋工程、食品科学与工程、水产养殖学、物流管理、产品设计 、计算机科学与技术、汉语言文学、地理信息科学等适应社会需求的专业。
大学毕业证编号:11607;现任校长:林基明。